श्रीमदभागवद के 12वें स्कन्द में कहा गया है - सम्भलग्राममुखस्य ब्राह्मणस्य महात्मन: भवने विष्णुयशस: कल्कि: प्रादुर्भविष्यति.....यानि कलियुग में भगवान विष्णु कल्कि नाम के अवतार में संभल नामक स्थान पर आएंगे। ये मंदिर भगवान विष्णु के होने वाले उसी दसवें कल्कि अवतार को समर्पित है।
